Es una entidad pública, sin ánimo de lucro, que tiene por objeto la cooperación económica, técnica y administrativa entre las entidades que lo integran (Ministerio de Defensa, Generalidad de Cataluña y Ayuntamiento de Figueres), para la gestión, organización e intensificación de las actuaciones relativas a la conservación, restauración y revitalización de la fortaleza de San Fernando.
El Consorcio nace a raíz del Convenio de Colaboración, suscrito el 6 de noviembre de 2003, entre el Ministerio de Defensa, la Generalidad de Cataluña y el Ayuntamiento de Figueres para la puesta en valor cultural del Castillo de San Fernando en Figueres.
Como consecuencia de este Convenio se redacta y aprueba los Estatutos del Consorcio Castillo San Fernando y el Ministerio de Defensa cede al Consorcio el uso de los terrenos e instalaciones del Castillo por un período de cincuenta años.