El arsenal se articula en torno a un patio central, es casi rectangular y de grandes dimensiones. Tiene dos plantas, formadas, en los cuerpos del este y del oeste, por grandes naves. En la planta baja del lado este está abierta al patio formando un gran porche. Los cuerpos norte y sur que completaban el inmueble los formaban cuatro bóvedas dedicadas a dependencias diversas, incluida la escalera. Precisamente la zona sur, en el que se encontraba la escalera quedó tan derruido por la voladura de año 1939, que fue necesario suprimirlo y cerrar el edificio con una nueva fachada retrasada unos veinte metros.
En la actualidad se encuentran las oficinas del Consorcio y las Salas para conferencias y eventos, en una de las salas “Juan Caballero” se encuentra montada una exposición temporal del Museo Histórico Militar.